En
la edición de hoy de la revista Nature Genetics, investigadores del Centro Genómica de Nueva York y la
Universidad de Columbia detallan un mecanismo molecular conocido como penetrancia
modificada, que plantea que las variantes genéticas que regulan la actividad de
los genes modifican el riesgo de la enfermedad por las variantes del gen de
codificación de proteínas. El estudio vincula la penetrancia modificada a enfermedades
específicas a nivel genómico, que tienen implicaciones en la predicción futura de
enfermedades graves como el cáncer y el trastorno del espectro autista. La penetrancia
modificada plantea la idea de que las variantes genéticas que regulan la
activación de genes también podrían desempeñar un papel en la modificación de
la penetración de variantes de codificación para el mismo gen. Para probar esta
hipótesis los investigadores analizaron datos del Atlas del genoma del cáncer
de los Institutos Nacionales de Salud y la Colección Simons Simplex, un
repositorio permanente de muestras genéticas de 2.600 familias, cada una de las
cuales tiene un niño afectado con un trastorno del espectro autista y padres y
hermanos no afectados. En los pacientes con cáncer e individuos con autismo,
encontraron un enriquecimiento de los haplotipos que se predice que aumentarán
la penetración de las variantes de codificación asociadas con el cáncer y el
trastorno del espectro autista, respectivamente. Finalmente, diseñaron un
experimento utilizando la tecnología de edición de genoma CRISPR / Cas9 para
probar la hipótesis para ello editaron una línea celular en diferentes
haplotipos con una variante reguladora. Los investigadores pudieron demostrar
que la variante reguladora modificó el efecto de la variante codificante de la
enfermedad, de acuerdo con las expectativas basadas en la recopilación de datos
a gran escala. Este hallazgo proporciona un marco importante para los
científicos para probar experimentalmente enfermedades específicas para determinar
si son afectadas por la penetrancia modificada. El objetivo a largo plazo de la
investigación es una mejor predicción de si un individuo va a tener una
enfermedad, utilizando sus datos genéticos mediante la integración de las
variantes reguladoras y de codificación.
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